水产品加工及贮藏工程学科为浙江省重点学科（2012年），始建于1958年，得益于世界著名三大渔场之一的舟山渔场丰富的海洋生物资源，从而得到迅速发展并成为当时的浙江水产学院重点学科，是全国最早开设水产品加工及贮藏学科专业的单位之一。20世纪80年代，学科整体并入宁波大学；2002年，重新组建本学科。经过长期的历史积淀和近十年的快速发展，本学科依托食品与药学学院、浙江省海洋水产研究所等，建有科技部海洋领域国际合作基地、国家水产品头足类加工技术研发中心、浙江省水产品加工及贮藏技术国际科技合作基地、农业部渔业环境及水产品质量监督检验测试中心、浙江省海产品健康危害因素关键技术研究重点实验室、海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心（共建）、浙江省食品工程与安全实验教学中心等多个学科平台。